辣椒立枯病由立枯丝核菌引起，属于半知菌亚门真菌。菌丝有隔，初期无色，后期变黄褐色至深褐色，分枝基部稍缢缩，与主菌丝成直角。菌丝成熟后变成一串桶形的细胞，并交织成松散不定形的菌核，浅褐色、棕褐色至暗褐色。
辣椒苗生长缓慢、矮小，仔细观察幼苗茎基部，可见茎基部出现椭圆形的暗褐色病斑，有同心轮纹。幼苗的叶片在白天会出现萎蔫的症状，但一早一晚可以恢复，过几天后往往就会逐渐枯萎而死。
辣椒立枯病主要危害秧苗的茎基部，发病初期辣椒苗茎基部出现椭圆形的暗褐色病斑，有同心轮纹。幼苗白天萎蔫，早晚恢复正常。随着为害不断加重，病斑逐渐凹陷扩大，绕茎一周有的木质部暴露在外，造成病部收缩、干枯，导致秧苗死亡。但幼苗并不立即倒伏，仍然保持直立状态，故称“立枯病”。
农业防治：
1、尽量避免使用带菌土壤，苗床进行消毒（参看猝倒病防治）。不使用未腐熟肥料。作好苗床的通风透气工作。
2、发病后，撒草木灰或干细土并病菌。本病可结和猝倒病一并防治。
药剂防治：
甲霜·噁霉灵-沃施美
净含量：5kg
对植物立枯病、枯萎病、腐霉病、黄萎病、猝倒病、沤根、和根腐病有很好的预防效果。